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SMARTer Stranded Total RNA Sample Prep Kit – HI Mammalian
品牌	Code No.	产品名称	包装量	价格（元）	说明书	数量
Clontech	634873	SMARTer® Stranded Total RNA Sample Prep Kit – HI Mammalian	12 Rxns	￥17,520
Clontech	634874	SMARTer® Stranded Total RNA Sample Prep Kit – HI Mammalian	24 Rxns	￥29,766
Clontech	634876	SMARTer® Stranded Total RNA Sample Prep Kit – HI Mammalian	96 Rxns	￥88,161
Clontech	634877	SMARTer® Stranded Total RNA Sample Prep Kit – HI Mammalian	192 Rxns	￥140,875
Clontech	634878	SMARTer® Stranded Total RNA Sample Prep Kit – HI Mammalian	480 Rxns	￥290,743
Clontech	634875	SMARTer® Stranded Total RNA Sample Prep Kit – HI Mammalian	48 Rxns	￥54,845

SMARTer Stranded Total RNA Sample Prep Kit- HI Mammalian—以高起始量总RNA构建Illumina测序平台链特异性RNA-Seq文库

· 保留链来源信息—转录本链来源识别准确率>99% · 快速，简便流程-从开始到结束~ 5h · 起始范围广—适用于人，小鼠或大鼠100 ng-1 μg总RNA · 适用样品范围广-不同品质RNA，不同重复间均可获得可靠数据。    RIN (RNA Integrity Number) 值3-10的总RNA均可获得高质量重复数据 · 兼容Illumina测序-构建96 index Illumina测序文库，并保留链来源信息   SMARTer Stranded Total RNA Sample Prep Kit – HI Mammalian提供了从100 ng–1 μg哺乳动物总RNA构建Illumina index测序文库的快速解决方案。本试剂结合了RiboGone和SMART技术，可以无缝融合rRNA去除和链特异性文库构建过程，整个过程只需约5小时。由于rRNA约占总RNA的90%，在文库构建前高效去除这些高丰度转录本可以降低测序成本，提升数据比对率。核心SMART技术可以在RT和PCR扩增过程中添加index和测序接头，无需下游文库构建，并且可以保留链来源信息。 这些高通量试剂包含12条反向引物和8条正向引物可以生成多至96个独立index文库。整个流程-从rRNA去除到Illumina专用index RNA-Seq文库-只需约5小时。   不同样品起始量解决方案： · 250 pg-10 ng总RNA，推荐使用 SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2- Pico Input Mammalian · 10-100 ng总RNA，推荐使用 SMARTer Stranded Total RNA Sample Prep Kit – Low Input Mammalian

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SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 – Pico Input Mammalian
品牌	Code No.	产品名称	包装量	价格（元）	说明书	数量
Clontech	635005	SMARTer® Stranded Total RNA-Seq Kit – Pico Input Mammalian	12 Rxns	￥15,684
Clontech	635006	SMARTer® Stranded Total RNA-Seq Kit – Pico Input Mammalian	48 Rxns	￥46,033
Clontech	635007	SMARTer® Stranded Total RNA-Seq Kit – Pico Input Mammalian	96 Rxns	￥63,435
Clontech	634411	SMARTer® Stranded Total RNA-Seq Kit v2 – Pico Input Mammalian	12 Rxns	￥12,881
Clontech	634412	SMARTer® Stranded Total RNA-Seq Kit v2 – Pico Input Mammalian	48 Rxns	￥43,794
Clontech	634413	SMARTer® Stranded Total RNA-Seq Kit v2 – Pico Input Mammalian	96 Rxns	￥57,613
Clontech	634414	SMARTer® Stranded Total RNA-Seq Kit v2 – Pico Input Mammalian	192 Rxns	￥103,664

SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 – Pico Input Mammalian以皮克级总RNA构建Illumina链特性RNA-seq文库

· 皮克级样品起始—可以250 pg-10 ng人，小鼠或大鼠总RNA起始 · 用途广泛—可以不同品质RNA（包括FFPE/LCM样品及游离RNA）制备文库，获得高重复再现数据 · 性能提升-不增加PhiX也可获得较高的簇通过过滤百分比（FP%），识别更多转录本，重复更少 · 保留链来源信息—转录本链来源信息识别准确度高 · 快速，一体化流程—整体流程只需~6 h ，改良了buffer配方，缩短了文库纯化时间 · 无缝衔接Illumina测序—直接制备多达96种index的 Illumina®-ready文库   SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 – Pico Input Mammalian设计用于从皮克级总RNA(250 pg–10 ng)中高效制备Illumina测序文库。本试剂中采用的技术适用于高品质，部分降解及低品质RNA（如来自于FFPE或LCM样品）。本试剂是一体化操作流程，保留了链来源信息，并且不需要下游文库制备，在反转录和PCR扩增过程中就可以添加indexes和接头。升级产品与原有SMARTer 皮克级产品相比，提升了在所有Illumina测序平台的测序性能，并且文库纯化操作更加方便。 核糖体RNA在总RNA中占有很高的比重（~90%）。在制备文库前从总RNA中去除掉这些大量的RNA，有利于降低测序成本，提高统计数据的比对比率。但是在以微量样品起始时，如果一开始就从总RNA中去除rRNA，会造成纯化后的起始样品太少而不能制备高品质测序文库，本试剂采用专有的特异针对哺乳动物rRNA和部分线粒体RNA的探针去除核糖体cDNA（来源于核糖体RNA的cDNA片段）。采用本试剂制备的文库与前代试剂制备的文库接头配置不同，即使是使用基于双通道SBS技术的Illumina平台如NextSeq®， MiniSeq™， 和 HiSeq® 3000/4000测序时，不需要添加大量PhiX也可以获得高比例的簇通过过滤百分比(%PF)。每个run可以获得更多的生物学相关测序reads，这又反过来减少了测序成本。采用Pico v2 Kit同样可以获得更多的特异转录本，更低的rRNA、mtRNA比对率和重复率。此外，Pico v2 Kit包含了一种新的PCR buffer，提高了文库纯化效率。 试剂盒提供12，48，96和192次反应规格。高通量版本试剂 (Code No. 634413,634414) 包含12种反向引物，8种正向引物，最多可以构建96种indexes文库。包括文库构建及纯化的整体流程只需~6 h。   不同样品起始量解决方案： · 10-100 ng 总RNA, 推荐使用 SMARTer Stranded Total RNA Sample Prep Kit – Low Input Mammalian · 100 ng-1 μg总RNA, 推荐使用SMARTer Stranded Total RNA Sample Prep Kit – HI Mammalian   图1. SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 – Pico Input Mammalian技术流程   图2. SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 – Pico Input Mammalian提高了通过过滤百分比（FP%）。如图所示，分别采用Pico v1 或Pico v2制备文库并使用NextSeq 500 或 MiniSeq平台测序。图中，蓝色图框表示未过滤（原始）reads的簇密度分布，绿色图框表示通过过滤reads的簇密度分布。 图中显示了通过过滤的reads数（以百万计）和每个run的%PF。

图3. 新的SeqAmp CB PCR buffer利于磁珠-沉淀物形成。Pico v2中的PCR buffer经过重新设计可以更快、更紧密的形成磁珠-沉淀物。经过磁力分离后，在新的SeqAmp CB buffer（右）中的沉淀物比原来PCR buffer（左）中的沉淀物更紧密。紧密的沉淀物比松散的沉淀物更容易干燥，易于重悬。

图4. SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 – Pico Input Mammalian 提升了灵敏度和重复再现性。上图为以1 ng和10 ng人肺FFPE来源的总RNA起始，分别采用Pico v1和Pico v2构建文库，NextSeq 500测序数据。Panel A. 以1 ng和10 ng样品起始，分别采用Pico v1和v2构建文库的测序数据。Panel B. 不同样品起始量之间，转录本表达水平的比较分析。

Technote： 点击图片查看 SMARTer Stranded RNA-Seq PICO： 点击图片下载     延伸阅读 病原微生物NGS解决方案来了，您准备好项目了吗？ Takara真香推荐—简便准确好用的液态活检解决方案之游离RNA篇 『石以砥焉，化钝为利！』Takara匠心打磨FFPE样本分析利器   产品详情请点击：

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SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 – Pico Input Mammalian
品牌	Code No.	产品名称	包装量	价格（元）	说明书	数量
Clontech	634485	SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 – Pico Input Mammalian	24 Rxns	￥30,451
Clontech	634486	SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 – Pico Input Mammalian	48 Rxns	￥47,045
Clontech	634487	SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 – Pico Input Mammalian	96 Rxns	￥63,820
Clontech	634488	SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 – Pico Input Mammalian	192 Rxns	￥114,044

带分子标签的微量样本的链特异RNA-Seq分析 SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 – Pico Input Mammalian

· 高灵敏度：可以人、大鼠或小鼠来源的250 pg-10 ng的总RNA或10-1000个细胞起始 · 添加UMI：校正来自PCR错误、重复序列以及序列错误的读取 · 用途广泛：能分析质量较差的FFPE、LCM以及cfRNA来源的样本 · 操作简便：仅需要7.5小时即可完成文库构建 · 无缝衔接Illumina测序：直接制备多达192种index的Illumina® -ready文库   SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 – Pico Input Mammalian（Pico v3）设计用于从皮克级总RNA(250 pg-10 ng)中高效制备Illumina测序文库。本试剂盒采用的技术适用于高品质、部分降解及低品质RNA（如来自于FFPE或LCM样品）。升级产品与原有SMARTer 皮克级产品相比，提升了在所有Illumina测序平台的测序性能，并且还添加特别的分子条形码（UMI），从而可以消除PCR错误或duplication以及测序偏向。   本试剂盒采用一体化操作流程，保留了链来源信息，在反转录和PCR扩增过程中就可以添加indexes和接头。整个流程，包括文库构建及纯化仅需约7.5小时。 该试剂盒包含SMARTer RNA Unique Dual Index Kit – 24U (Code No. 634451)。另外也可以与SMARTer RNA Unique Dual Index Kits (Code No. 634452 & 634457，可单独购买）搭配使用，最多可构建多达192种indexes文库。   图1. SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 – Pico Input Mammalian技术流程   图2. 使用SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 – Pico Input Mammalian制备文库的结构特征

接头序列包含：通过PCR 1反应添加的可以与Illumina流动池结合生成簇的P7、P5序列（P7以淡蓝色表示，P5以红色表示），用于区分单个lane上多个样本的Index序列（Index 1 [i7] 序列连接在P7端，Index 2 [i5]连接在P5端）。并且还包括识别测序引物区域的Read 2（紫色）和 Read 1（绿色）。通过Read 1起始得到的原始RNA的反义链序列，Read 2起始获得的是原始RNA的正义链序列。其中，通过Read 2起始时，前8个碱基是UMI（深紫色），UMI之后的3个碱基（XXX）是Pico v3 Adapter衍生的序列。

表 1. 不同样本起始量的分析结果。

以0.5、1、5和10 ng人肺FFPE组织提取的总RNA起始，采用SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 – Pico Input Mammalian制备RNA-Seq文库（均做两个重复），并使用NextSeq 500进行测序。

Technote： 点击图片查看 SMARTer Stranded RNA-Seq Pico v3: 点击图片下载

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