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SMARTer smRNA-Seq Kit for Illumina酶试剂盒Takara Clontech

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SMARTer smRNA-Seq Kit for Illumina
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格（元） 说明书 数量
Clontech 635029 SMARTer® smRNA-Seq Kit for Illumina 12 Rxns ￥8,777 SMARTer smRNA-Seq Kit for Illumina SMARTer smRNA-Seq Kit for Illumina SMARTer smRNA-Seq Kit for Illumina
Clontech 635030 SMARTer® smRNA-Seq Kit for Illumina 48 Rxns ￥31,178 SMARTer smRNA-Seq Kit for Illumina SMARTer smRNA-Seq Kit for Illumina SMARTer smRNA-Seq Kit for Illumina
Clontech 635031 SMARTer® smRNA-Seq Kit for Illumina 96 Rxns ￥55,431 SMARTer smRNA-Seq Kit for Illumina SMARTer smRNA-Seq Kit for Illumina SMARTer smRNA-Seq Kit for Illumina
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SMARTer smRNA-Seq Kit for Illumina  
 
 
SMARTer smRNA-Seq Kit for Illumina—高灵敏度，低偏差的小RNA测序
· 分析不同种类的小RNA—适用于15-150 nt 小RNA测序文库构建
· 起始样品灵活—可以 1 ng-2 μg总RNA或富集的小RNA起始
· Illumina-ready 测序文库—无需接头连接即可添加Illumina接头和indexes序列
· 快速的单管操作—~3 h即可构建测序文库（不包括检测和PCR后片段筛选过程）
 
发现和分析小非编码RNA(smRNAs)已经成为理解基因表达调控非常重要的一部分。一些熟知的小RNA种类如miRNAs, siRNAs, piRNAs和snoRNAs长度在20到30 nt。 SMARTer smRNA-Seq Kit for Illumina专门设计用于从这些微量小RNA中构建高品质Illumina-ready测序文库。
试剂盒可以直接从1 ng-2 μg总RNA或富集的小RNA样品起始，与SMART-Seq V4 Kit相同，采用了SMART技术和LNA技术，不需要接头连接即可构建测序文库，可以确保多种类小RNA的代表性，并且偏差很小。
 
SMARTer smRNA-Seq Kit for Illumina
图1. SMARTer smRNA-Seq Kit for Illumina技术流程
 
SMARTer smRNA-Seq Kit for Illumina
图2. SMART法smRNA-seq的准确性
 
SMARTer smRNA-Seq Kit for Illumina
表1. 不同类型，不同起始量的总RNA主要测序数据
 
Technote：
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产品详情请点击：SMARTer smRNA-Seq Kit for Illumina
 
 

ThruPLEX Plasma-seq Kit酶试剂盒Takara Clontech

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ThruPLEX Plasma-seq Kit
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格（元） 说明书 数量
Clontech R400490 ThruPLEX® Plasma-seq 12S Kit 12 Rxns ￥6,297 ThruPLEX Plasma-seq Kit ThruPLEX Plasma-seq Kit ThruPLEX Plasma-seq Kit
Clontech R400491 ThruPLEX® Plasma-seq 48S Kit 48 Rxns ￥21,798 ThruPLEX Plasma-seq Kit ThruPLEX Plasma-seq Kit ThruPLEX Plasma-seq Kit
Clontech R400492 ThruPLEX® Plasma-seq 96D Kit 96 Rxns ￥39,157 ThruPLEX Plasma-seq Kit ThruPLEX Plasma-seq Kit ThruPLEX Plasma-seq Kit
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高品质血浆来源cell free DNA NGS文库构建试剂
ThruPLEX® Plasma-seq Kit
· 专为cfDNA设计：经过优化的修复及连接试剂
· 高品质NGS文库：在宽广的GC含量范围内，可以达到高检测再现性
· 起始量范围广：＜1 ng到30 ng cfDNA量
· 快速简便：无需纯化或样品转移的单管、2小时、3步操作步骤
· 应用领域：液态活检、ctDNA、目标区域测序等领域文库构建
· 兼容自动化平台：Beckman® FXP Workstation
 
■ 产品说明：
ThruPLEX® Plasma-seq基于ThruPLEX技术，并用于血浆来源cfDNA高品质NGS文库构建。
该试剂专门针对cfDNA进行优化，在保持样本GC代表性的基础上，提升了文库的信息容量。文库构建后可用于CNV分析、全基因组测序分析或是采用一些panel针对目标区域进行捕获富集后的DNA分析,如Agilent SureSelect® and Roche NimbleGen SeqCap® EZ。
血浆样品采用ThruPLEX Plasma-seq试剂盒制备文库，能有更好的灵敏度、更准确的基因变异分析结果。与其它液态活检的样品一样，血浆由于其易获得、价值高的特点，深受研究肿瘤学或者孕妇血浆中胎儿游离DNA科研工作者的重视。
 
ThruPLEX Plasma-seq Kit
图1. ThruPLEX® 技术概要。ThruPLEX Plasma-seq Kit技术3步反应即可完成针对cell free DNA的建库工作。1~30 ng含量的cf DNA首先高效的进行末端修复。通过采用茎环形接头（无单链尾巴）进行高效平端连接，降低了背景。封闭的5’端阻止了接头-接头二聚体形成。随后未使用的接头被降解，进一步降低背景。高保真度扩增的方式完成以上反应，并获得含有illumina index的文库。
（*图片来源于Takara Bio USA,Inc.）
 
ThruPLEX Plasma-seq Kit
图2. 高cfDNA文库多样性、更少的Unmapped Reads。ThruPLEX Plasma-seq Kit构建的文库，具有高的多样性和低的duplicates和unmapped reads。图中表示cfDNA分别提取于3份血浆样品，文库定量采用Qubit荧光定量。Bioanalyzer测定mononucleosomal DNA在各样品的量分别为0.09 ng、0.62 ng、15.44 ng。Pooled libraries采用illumina NextSeq 500 paired end模式测序，且每个文库产生17 M到25 M reads。每个文库在down-sampling数据至17 M reads以后，计算Duplication rates。
（*图片来源于Takara Bio USA,Inc.）
 
ThruPLEX Plasma-seq Kit
图3. 优异的靶向测序文库构建能力。图中所示ThruPLEX Plasma-seq Kit构建的文库通过panel进行高效捕获，对kinome进行深度测序分析以检测突变。3个血浆样品分别起始建库量为5 ng、6.5 ng、10 ng，三次重复。目标区域采用SureSelectXT2的ClearSeq Human DNA Kinome Panel进行捕获，并用Illumina Miseq平台进行测序，平均每个文库获得5 M reads，目标碱基被成功捕获分析。
（*图片来源于Takara Bio USA,Inc.）
 
ThruPLEX Plasma-seq Kit
图4. 高重复性的、无偏倚的GC覆盖度。针对人类基因组，ThruPLEX Plasma-seq Kit表现出高再现性、低偏倚GC覆盖度NGS文库构建能力。9次独立的血浆样品文库构建的实验结果表明，ThruPLEX重复性高于其它产品。文库的制备是利用的1 mL血浆来源cfDNA，后续采用illumina NextSeq 500进行测序。作为对比，A公司试剂构建了4份独立血浆样品的文库。
（*图片来源于Takara Bio USA,Inc.）
 
ThruPLEX Plasma-seq Kit
图5. Karolinska协会和CRUK测试的结果。5 ng游离cf DNA采用ThruPLEX Plasma seq Kit进行illumina文库构建。结果表明利用Hiseq平台进行的Low-pass WGS,每个文库能获得接近12.5 M reads。
（*以上数据来源于Karolinska 协会，瑞典）
 
■ 产品组成
· Template Preparation Buffer（Red）
· Template Preparation Enzyme（Red）
· Library Synthesis Buffer（Yellow）
· Library Synthesis Enzyme（Yellow）
· Library Amplification Buffer（Green）
· Library Amplification Enzyme（Green）
· Nuclease-Free Water（Clear）
· Indexing Reagents（Blue）
· Quick Protocol（N/A）
 
■ 保存
－20℃
 
 
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SMART-Seq v4 Ultra Low RNA Kit for the Fluidigm C1 System酶试剂盒Takara Clontech

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SMART-Seq v4 Ultra Low RNA Kit for the Fluidigm C1 System
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格（元） 说明书 数量
Clontech 634832 SMARTer Ultra Low RNA Kit for the Fluidigm C1 System Each ￥13,576 SMART-Seq v4 Ultra Low RNA Kit for the Fluidigm C1 System SMART-Seq v4 Ultra Low RNA Kit for the Fluidigm C1 System SMART-Seq v4 Ultra Low RNA Kit for the Fluidigm C1 System
Clontech 634833 SMARTer Ultra Low RNA Kit for the Fluidigm C1 System Each ￥48,984 SMART-Seq v4 Ultra Low RNA Kit for the Fluidigm C1 System SMART-Seq v4 Ultra Low RNA Kit for the Fluidigm C1 System SMART-Seq v4 Ultra Low RNA Kit for the Fluidigm C1 System
Clontech 635025 SMART-Seq v4 Ultra Low Input RNA Kit for the Fluidigm C1 System, 4 IFCs Each ￥16,692 SMART-Seq v4 Ultra Low RNA Kit for the Fluidigm C1 System SMART-Seq v4 Ultra Low RNA Kit for the Fluidigm C1 System SMART-Seq v4 Ultra Low RNA Kit for the Fluidigm C1 System
Clontech 635026 SMART-Seq v4 Ultra Low Input RNA Kit for the Fluidigm C1 System, 10 IFCs Each ￥33,489 SMART-Seq v4 Ultra Low RNA Kit for the Fluidigm C1 System SMART-Seq v4 Ultra Low RNA Kit for the Fluidigm C1 System SMART-Seq v4 Ultra Low RNA Kit for the Fluidigm C1 System
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SMART-Seq v4 Ultra Low RNA Kit for the Fluidigm C1 System
—性能卓越的单细胞转录组分析
· 升级的SMART技术—带有LNA修饰的SMART-Seq v4 oligo 加升级的配方带来更好的性能
   (更高灵敏度，更好重复性，更多的GC-rich基因)
· 文库构建只需2天—cDNA合成约需2h，其次需要在Fluidigm C1平台中运行8小时的
   SMART-Seq v4 script，整个文库构建过程可以在2个工作日内完成
· 新script—支持mRNA Seq IFC 和 Open App IFC，SMART-Seq v4 script可以从
   Fluidigm Script Hub下载
 
单细胞转录组研究对于细胞群体内每个细胞的基因表达变化研究是非常重要的。Takara Clontech 开发了兼容Fluidigm IFC （integrated fluidic circuit）的强大的单细胞研究工具。高灵敏度的SMARTer技术结合高通量自动化的Fluidigm C1系统，可以对转录组进行深入细致分析。
我们提供两种版本的单细胞mRNA-Seq 试剂，用于Fluidigm C1单细胞自动制备系统。新版本SMART-Seq v4 Ultra Low Input RNA Kit for the Fluidigm C1 System沿袭了SMART-Seq v4的优势，结合了SMART技术和LNA修饰，称为"SMARTer-seq® chemistry"。本试剂超越了发表过的操作流程和以往版本的试剂，利用本试剂可以获得灵敏度更高，重复性更好，GC-rich、AT-rich基因代表性更好的测序数据。适用于本试剂的新script支持mRNA Seq IFC 和 Open App IFC，可以从Fluidigm Script Hub下载获得。
 
Technote：
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产品详情请点击：SMART-Seq v4 Ultra Low RNA Kit for the Fluidigm C1 System
 
 

SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit酶试剂盒Takara Clontech

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SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格（元） 说明书 数量
Clontech R400748 SMART-Seq® HT PLUS Kit 48 Rxns ￥26,309 SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
Clontech R400749 SMART-Seq® HT PLUS Kit 96 Rxns ￥51,365 SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
Clontech R400744 Unique Dual Index Kit – 48U 48 Rxns 询价 SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
Clontech R400745 Unique Dual Index Kit – 96U 96 Rxns 询价 SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
Clontech 634455 SMART-Seq® HT Kit 12 Rxns ￥4,458 SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
Clontech 634456 SMART-Seq® HT Kit 48 Rxns ￥16,049 SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
Clontech 634436 SMART-Seq® HT Kit 480 Rxns ￥118,883 SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
Clontech 634437 SMART-Seq® HT Kit 96 Rxns ￥30,910 SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
Clontech 634438 SMART-Seq® HT Kit 192 Rxns ￥57,064 SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
Clontech 634439 SMART-Seq® HT Lysis Components 96 Rxns ￥1,199 SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
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SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit 延伸     SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit ↘ SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
← SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit → SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
         
SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit ↗
 
 
SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT Plus Kit：自动化友好型的单细胞mRNA全长分析
· 自动化友好型 - 兼容自动化工作站，更少的时间分析更多的样本
· 高灵敏度 - 可以从单细胞或10 pg总RNA起始（起始量：1-100个细胞或10 pg-1 ng总RNA）
· 高质量的RNA-Seq数据 - 保留全长基因信息，低rRNA比率，高基因检出数，有效扩增GC-rich转录本
· 单管操作流程 - SMART-Seq HT PLUS Kit包含完整的cDNA合成和文库构建流程，分别在单管中进行，减少样品损失与混淆，降低手动操作误差
· 增强的测序性能 - SMART-Seq HT PLUS Kit整合双端特殊index（UDI），即便多个文库pool后用高通量型illumina测序仪（如Novaseq）分析，也能得到正确结果
· 更高的文库产量 - 更便于使用高通量型illumina测序仪测序（如Novaseq），或保存剩余的文库用于多次测序
 
■ 产品说明
SMART-Seq HT Kit（SS-HT）和SMART-Seq HT Plus Kit（SS-HT PLUS）均兼容自动化移液工作站，采用oligo(dT)引物，支持1-100个细胞或10 pg-1 ng总RNA起始。
SS-HT试剂盒是从第4代的SMARTer Ultra Low试剂（SMART-Seq v4）发展而来的，具有简化的操作流程，将原有的反转录和PCR扩增步骤整合为一步，且不影响性能。细胞分离或RNA提取后，仅通过一步RT-PCR扩增双链cDNA，然后进行纯化完成操作。cDNA合成可在4小时内完成，整个文库构建方案可在2天内完成。而且，SMART-Seq HT试剂盒具有与SMART-Seq v4试剂盒相同的灵敏度和可重复性。核心的SMART技术，是一种对全转录组研究，以及包括细胞内剪接位点，可变剪接研究的非常强大的工具，且可以检测全长基因。 Oligo（dT）可以从高品质总RNA（RIN> 8）或完整细胞中特异性扩增mRNA。 通过采用LNA技术，提升了模板转换的效率与基因检出数等性能。
SS-HT PLUS Kit在包含核心的cDNA合成试剂基础上，同时整合了Takara Bio Group专利性的文库构建技术（U.S. Patents 7,803,550, 8,399,199, 8,728,737, 9,598,727,10,196,686, 10,208,337, and 11,072,823）及单次使用的双端特殊index（UDI），提供完整的单细胞cDNA合成到文库构建的实验体验。建库试剂中包含片段化酶，以实现对合成cDNA的片段化，接着利用特别的茎环形接头构建高品质illumina文库。在建库阶段，单管两步操作、过程中无需纯化、2 h即可建成文库！
 
■ SS-HT Kit：流程缩短、性能不变！
SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
图1 SMART-Seq HT的技术流程
 
SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
图2 SMART-Seq v4和SMART-Seq HT工作流程的比较
 
SMART-Seq HT（右）是由SMART-Seq v4方法（左）经过改进而来的一个手动操作时间更短的高通量工作流程。使用FACS方法获得单细胞，SMART-Seq HT试剂盒只需3个操作步骤即可制备cDNA，而SMART-Seq v4试剂盒需要6步。SMART-Seq HT工作流程的一个重要步骤是一步RT-PCR，即使用一步RT-PCR缓冲液，进行高效的反转录和PCR扩增cDNA的过程。
 
SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
图3 使用SMART-seq v4 kit和SMART-Seq HT kit从FACS分选的293T细胞中获得的高重复性的基因表达数据
 
使用SMART-Seq v4试剂盒（SSv4_1-SSv4_12）和SMART-Seq HT试剂盒（ HT_1-HT_9）（上图）从21个293T细胞单细胞制备文库，并对每个细胞获得的基因表达性进行评估。层次聚类热图展示了所有细胞之间的Euclidean distances，并显示从0.74到0.97的Pearson相关性。不仅用相同试剂盒制备的细胞之间可以观察到非常高的相关性，而在两种试剂盒之间的相关性也非常高。这些数据表明，SMART-Seq HT的工作流程与SMART-Seq v4相比，在基因表达分析中没有显著的偏差。
 
■ SS-HT PLUS Kit：不只是一个Kit，更是完整的单细胞RNA-Seq建库体验！
为了使单细胞cDNA合成、文库构建实验“一步”到位，我们全新推出了SS-HT PLUS Kit。
SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
 
SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
 
从高灵敏度、高重复性的cDNA合成出发，构建更高品质illumina文库
 
Takara科学家从10 pg小鼠脑total RNA起始，采用SMART-Seq HT Kit完成cDNA合成。随后分别使用SS-HT Plus Kit中的SMART-Seq Library Prep Kit模块与市面上较常用的A公司试剂盒构建文库，并比较性能差异。
 
SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
(比较数据来源于Takara Bio USA, Inc.)
 
从测试数据中可以看出，SS-HT PLUS Kit所建文库的产量是A公司Kit产量的5倍，而更高的文库产量更适于高通量型Illumina测序仪，如Novaseq。
 
两种方法所建文库随后用Nextseq 500完成测序，并对TPM(Transcripts per million)≥0.1的基因数进行统计。SS-HT PLUS文库能比A公司文库多检出10%的基因，从同样的cDNA起始能“捕获”更全的信息！
 
 
产品详情请点击：SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
 
更多实验数据：
SS-HT Kit
SS-HT Plus Kit
 
延伸阅读：
单细胞NGS解决方案
 
 

PicoPLEX DNA-seq Kit酶试剂盒Takara Clontech

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PicoPLEX DNA-seq Kit
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格（元） 说明书 数量
Clontech R300381 PicoPLEX® DNA-seq Kit 48 Rxns ￥18,375 PicoPLEX DNA-seq Kit PicoPLEX DNA-seq Kit PicoPLEX DNA-seq Kit
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Illumina单细胞起始高再现性测序文库构建
PicoPLEX® DNA-seq Kit
· 高再现性：拷贝数变异（CNV）及染色体异倍性检测重复性高
· 完整的文库构建试剂：包含所有文库构建所需试剂
· 简便的工作流程：从单细胞到测序可用文库仅需三步
· 快速：3小时内完成Illumina NGS文库构建
· 低污染、低错误发生率：单管内完成文库构建，无需转移
 
■ 产品说明：
PicoPLEX® 技术过去常结合基因芯片技术用于检测单细胞层面基因拷贝数变异，现在可以在单管中构建Illumina NGS分析的文库。PicoPLEX® WGA在全球被IVF行业供应商信赖并用于胚胎植入前遗传学筛查和诊断（PGS/PGD）。
PicoPLEX® DNA-Seq Kit简化了文库制备的过程；整个制备过程可在单管或单孔中完成，降低了错误和样品污染的概率，加速了实验进程，并且削减了实验成本。PicoPLEX® DNA-Seq Kit具有48次反应规格，具备完整的48个单独细胞或DNA（6 pg至60 pg）起始的NGS文库构建试剂，包括dual Barcodes。单微孔板中含有Barcoding Oligonucleotides。
 
PicoPLEX DNA-seq Kit
图1. PicoPLEX 技术概要
 
PicoPLEX DNA-seq Kit
图2. PicoPLEX DNA-seq测序工作流程。用于Illumina NGS平台测序文库构建的主要步骤，其中PCR板可用单管代替。
 
PicoPLEX DNA-seq Kit
图3. 染色体异倍性分析的重复性。经流式细胞仪分选出11个不同步的H929细胞，使用本试剂盒制备文库后，经MiSeq测序，将获得的35个base single-end reads比对到人类基因组，对总计250,000 reads进行分析，各细胞得到的结果相同，显示了很高的重现性。
 
PicoPLEX DNA-seq Kit
图4. NGS与Array分析的比较验证。使用同一胚胎单细胞库分别进行Array和NGS分析，确认本制品和24 sure array（Illumina）两者的等效性。NGS的结果与Array的结果一致。测序结果显示：2p检测到末端丢失（图示），12q检测到末端增加（数据未展示），经高分辨率的FISH分析确认，是与亲代DNA漏检的易位相关。
*数据来源于Genetics & IVF Institute.
 
PicoPLEX DNA-seq Kit
图5. 无需进行文库定量。采用流式细胞仪分选的不同步的H929细胞，使用本试剂盒进行文库构建后，Miseq平台进行测序。由于本产品高重复性的特点，在文库pooling前无需进行定量。注: 图中空白的条带表示该位置处细胞缺失。
 
■ 产品组成
· Cell Extraction Buffer（Green）
· Extraction Enzyme Dilution Buffer（Violet）
· Cell Extraction Enzyme（Yellow）
· Pre-Amp Buffer（Red）
· Pre-Amp Enzyme（White）
· Amplification Buffer（Orange）
· Amplification Enzyme（Blue）
· Nuclease-Free Water（Clear）
· Dual Index Plate
· Quick Protocol
 
■ 保存
－20℃
 
 
产品详情请点击：PicoPLEX DNA-seq Kit
 
 
 
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