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SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit酶试剂盒Takara Clontech

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上海金畔生物科技有限公司代理Takara Clontech酶试剂盒全线产品，欢迎访问官网了解更多产品信息和订购。

SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格（元） 说明书 数量
Clontech R400750 SMART-Seq® Single Cell PLUS Kit 48 Rxns ￥47,828 SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit
Clontech R400751 SMART-Seq® Single Cell PLUS Kit 96 Rxns ￥85,494 SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit
Clontech R400744 Unique Dual Index Kit – 48U 48 Rxns 询价 SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit
Clontech R400745 Unique Dual Index Kit – 96U 96 Rxns 询价 SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit
Clontech 634470 SMART-Seq Single Cell Kit 12 Rxns ￥13,341 SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit
Clontech 634471 SMART-Seq Single Cell Kit 48 Rxns ￥37,759 SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit
Clontech 634472 SMART-Seq Single Cell Kit 96 Rxns ￥65,697 SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit
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SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit 延伸     SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit ↘ SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit
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SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit ↗
 
 
SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell Plus Kit：更胜一筹的单细胞mRNA全长分析
· 简便，基于Plate的工作流程 - 可直接以FACS或其他方法分选的单细胞起始
· 单管操作流程 - SMART-Seq Single Cell PLUS Kit包含完整的cDNA合成和文库构建流程，分别在单管中进行，减少样品损失与混淆，降低手动操作误差
· 灵敏度高和一致性好 - 非常适用于单细胞（尤其是RNA含量非常低的细胞和细胞核）RNA-Seq的研究，可检测更多基因
· 可靠的全长cDNA分析 - 性能优于许多现有的单细胞全长cDNA合成方法，例如Smart-seq2
· 增强的测序性能 - SMART-Seq Single Cell PLUS Kit整合双端特殊index（UDI），即便多个文库pool后用高通量型Illumina测序仪（如Novaseq）分析，也能得到正确结果
· 高度灵活的工作流程 - 可与自动化设备兼容
· 更高的文库产量 - 更便于使用高通量型Illumina测序仪分析（如Novaseq），或保存剩余的文库用于多次测序
 
■ 产品说明
SMART-Seq Single Cell Kit (SSsc) 和SMART-Seq Single Cell PLUS Kit (SSsc PLUS) 是Takara科学家专门研发推出的两款具有高灵敏度和高可再现性的试剂盒，适用于单细胞和单个细胞核的RNA-Seq分析。试剂盒采用oligo（dT）引物，可从一些RNA含量非常低的单细胞（如PBMC, T细胞，B细胞）直接起始，并完成全长cDNA的捕获。
 
SMART-Seq Single Cell Kit是基于经典的SMART技术优化改良而来的单细胞cDNA合成试剂盒，可以提供全长转录本的信息，支持分析转录本异构体、融合基因、点突变等广受科研人员关注的研究内容，具有更高的灵敏度和再现性。此外，该试剂盒还能提供均一的gene body覆盖度，高GC含量转录本也能得到正确分析。这些改进使得SSsc更适合单细胞分析，能得到更多有效reads、更高的基因检测数，对珍贵样本的理解更透彻！这些特点使SSsc远远超过许多现有的单细胞全长cDNA合成方法，例如SMART-Seq2！
 
SMART-Seq Single Cell PLUS Kit在包含核心的cDNA合成试剂基础上，同时整合了Takara Bio Group专利性的文库构建技术（U.S. Patents 7,803,550, 8,399,199, 8,728,737, 9,598,727, 10,196,686, 10,208,337, and 11,072,823）及单次使用的双端特殊index（UDI），提供完整的单细胞cDNA合成到文库构建的实验体验。建库试剂中包含片段化酶，以实现对合成cDNA的片段化，接着利用特别的茎环形接头构建高品质Illumina文库。在建库阶段，单管两步操作、过程中无需纯化、2 h即可建成文库！
 
 
■ SSsc：更胜一筹的单细胞全长转录组分析！
 
SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit
The SMART-Seq Single Cell Kit outperforms Smart-seq2
图1. 与Smart-seq2法的比较
 
Takara科学家以淋巴母细胞系GM12878单细胞为样本制备文库，分别采用SMART-Seq Single Cell Kit(SSsc,18个重复)和Smart-seq2法（Smart-seq2，20个重复）合成cDNA（均进行19个PCR循环扩增），所有样本都均一化至1.75M paired-end reads，然后制备RNA-Seq文库并进行测序分析。
 
Panel A 根据cDNA的制备方法不同，结果也不同。相比而言，Smart-seq2结果中比对到线粒体基因组的比率较高，而检测到基因鉴别的reads数相对较少。
Panel B SMART-Seq Single Cell Kit能检测到比Smart-seq2更多的基因。
 
■ SSsc PLUS Kit：不只是一个Kit，更是完整且更胜一筹的单细胞RNA-Seq建库体验！
 
为了使单细胞cDNA合成、文库构建实验“一步”到位，我们全新推出了SSsc PLUS Kit，从此您无需再单独购买建库模块，也不用“忍受”不同厂家不同步的供货周期。
 
SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit
 
SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit
 
从高灵敏度、高重复性的cDNA合成出发，构建更高品质Illumina文库
 
Takara科学家以10 pg小鼠脑total RNA起始，采用SMART-Seq Single Cell Kit完成cDNA合成。随后分别采用SSsc Plus Kit中的SMART-Seq Library Prep Kit模块与市面上较常用的A公司试剂盒构建文库，并比较性能差异。
 
SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit
 
从测试数据中可以看出，SSsc PLUS Kit所建文库的产量是A公司Kit产量的5倍，而更高的文库产量更适于高通量型Illumina测序仪，如Novaseq。
 
SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit
 
两种方法所建文库随后用Nextseq 500完成测序，并对TPM(Transcripts per million)≥0.1的基因数进行统计。相较于A公司文库，SSsc PLUS文库能检出更多的基因，从同样的cDNA起始能“捕获”更全的信息！
 
SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit
 
比较数据来源于Takara Bio USA, Inc.
 
SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS KitSSsc点击图片下载
 
 
产品详情请点击：SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit
 
更多实验数据：
SSsc Kit
SSsc PLUS Kit
 
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单细胞NGS解决方案
 
 
 

GM Maize(Single Kernel)Detection Positive Control Plasmid 转基因玉米（单核）检测阳性对照质粒试剂 品牌：Nippon Gene

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GM Maize(Single Kernel)Detection Positive Control Plasmid

转基因玉米（单核）检测阳性对照质粒试剂

品牌：Nippon Gene
CAS No.：
储存条件：-20℃
纯度：–
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(生产商编号)

 等级 规格 运输包装 零售价(RMB) 库存情况 参考值

312-07232

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PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3酶试剂盒Takara Clontech

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上海金畔生物科技有限公司代理Takara Clontech酶试剂盒全线产品，欢迎访问官网了解更多产品信息和订购。

PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格（元） 说明书 数量
Clontech R300718 PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3 24 Rxns ￥5,518 PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3 PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3 PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3
Clontech R300722 PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3 96 Rxns ￥19,606 PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3 PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3 PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3
Clontech R300723 PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3 480 Rxns ￥83,328 PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3 PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3 PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3
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PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3
· 单细胞（或＜15 pg DNA）起始，可获得可重复的结果
· 卓越的等位基因再现性
· 易于使用和自动化
· 应用广泛，可以用于微阵列，PCR等
 
PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3 (PicoPLEX WGA v3)可以从单细胞扩增DNA，获得高度可重复的文库。细胞裂解和预扩增后，进行低背景的PCR扩增，并在3小时内获得微克级产物。
除了延续之前PicoPLEX WGA Kit可进行高度可重复的拷贝数变异（CNV）分析外，该试剂盒通过使用高保真酶，尽可能减少扩增误差，并能检测单核苷酸变异（SNV）。
 
PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3
图1. PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3技术
 
表1 .使用PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3进行高质量单核苷酸变异（SNV）检测
PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3
 
以单细胞 (1cell) 和5个细胞 (5 cells) 的GM12878细胞系 (Coriell研究所) 起始 (一式两份)，分别使用PicoPLEX WGA v3,A公司试剂盒和B公司试剂盒，以及bulk gDNA对照制备全基因组扩增产物，进行SNV检测的比较。其中B公司试剂盒虽然制备了足够的扩增产物，但只有5 cells样本中一个包含足够的扩增子进行测序，而其他样本无可用数据进行测序。根据Genome In a Bottle (GIB) 和hg19 (human Genome assembly GRCh37, Ensembl) 数据库的交叉分析，预计GM12879细胞系总共存在78个SNVs。由于扩增子的设计，2×75 bp的读取长度很短，78个SNVs中的4个未能检测到。因此，检测的SNV总数减少到74个。使用VarDict软件，以≥10reads (10X coverage) 和等位基因频率≥20％为基准从BAM文件分析SNV。与其他两个公司试剂盒相比，PicoPLEX WGA v3具有更高的call rates和更低的等位基因丢失率。
（数据来源于Takara Bio USA, Inc.）
 
PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3
图2. 基于PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3的CNV检测
 
以来自不同细胞系(GM22601、GM05067和GM12878)的单细胞起始，使用PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3扩增基因组。之后取1ng的扩增产物，使用Illumina Nextera XT Kit制备文库，并在Illumina MiSeq（PE 75）进行测序。对Fastq文件去除接头序列信息后，与human genome assembly GRCh37进行比对。只分析常染色体。对于这两个panels，校准归一化至100万reads，使用bedtools 2.25.0计算每1 Mb的 bin的reads数。使用Integrative Genomics Viewer (IGV)绘制bin counts的log2 ratio (Sample/Reference)。PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3还显示了可以高品质的进行染色体异倍性分析。
 
PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3
图3. PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3的全基因组覆盖范围的重现性高
 
以GM12878的单细胞样本起始（一式两份），分别使用PicoPLEX WGA v3，A公司试剂盒和B公司试剂盒扩增基因组。之后取1ng的扩增产物，使用Illumina Nextera XT Kit制备文库，并在MiSeq（PE 75）进行测序。然后与human genome assembly GRCh37进行比对，归一化至1M reads (0.5M paired-end reads)后，使用bedtools 2.25.0计算每个1 Mb的bin的reads数。对这两个单细胞文库的每个窗口的total read进行绘制，计算Pearson和Spearman相关性并在每个图中标明。
Panel A. 包含异常值的样本。*由于不同技术存在不同的偏差，没有排除相关点，所以图表的比例不同。
Panel B. 排除异常值的样本。与A公司和B公司试剂盒相比，PicoPLEX WGA v3具有更高的重现性和覆盖度。
（数据来源于Takara Bio USA, Inc.）
 
 
Technote：PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3
 
资料下载：PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3
 
产品详情请点击：PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3