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BIOSCORE® Screening and amplification kit (20 reactions) BioScore筛选和扩增试剂盒（20次反应） 品牌：Enzo

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品牌：Enzo
CAS No.：
储存条件：-20℃
纯度：–
产品编号

(生产商编号)

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ENZ-42440

 – 1 Kit – 8,410.00 – –


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使用新颖的全基因组扩增方法确定基因组DNA样品具有双重目的，可以在标记DNA前检测样品是否适用于微阵列分析，也可以几乎100%预测样品的特性。

任何来源的基因组DNA都可以作为扩增的模板，经过恒温全基因组扩增反应，只需要1小时就可从100ng的模板DNA获得超过10ug的高质量DNA。

特别适用于检测福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织的基因组DNA,组分:引物, 400 µl酶, 20 µl终止缓冲液, 110 µl核苷酸混合液, 200 µl无核酸酶水, 1 ml

单细胞全基因组扩增分析酶试剂盒Takara Clontech

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单细胞全基因组扩增分析
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格（元） 说明书 数量
Clontech R300718 PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3 24 Rxns ￥5,518 单细胞全基因组扩增分析 单细胞全基因组扩增分析 单细胞全基因组扩增分析
Clontech R300722 PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3 96 Rxns ￥19,606 单细胞全基因组扩增分析 单细胞全基因组扩增分析 单细胞全基因组扩增分析
Clontech R300723 PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3 480 Rxns ￥83,328 单细胞全基因组扩增分析 单细胞全基因组扩增分析 单细胞全基因组扩增分析
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PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3
· 单细胞（或＜15 pg DNA）起始，可获得可重复的结果
· 卓越的等位基因再现性
· 易于使用和自动化
· 应用广泛，可以用于微阵列，PCR等
 
PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3 (PicoPLEX WGA v3)可以从单细胞扩增DNA，获得高度可重复的文库。细胞裂解和预扩增后，进行低背景的PCR扩增，并在3小时内获得微克级产物。
除了延续之前PicoPLEX WGA Kit可进行高度可重复的拷贝数变异（CNV）分析外，该试剂盒通过使用高保真酶，尽可能减少扩增误差，并能检测单核苷酸变异（SNV）。
 
单细胞全基因组扩增分析
图1. PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3技术
 
表1 .使用PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3进行高质量单核苷酸变异（SNV）检测
单细胞全基因组扩增分析
 
以单细胞 (1cell) 和5个细胞 (5 cells) 的GM12878细胞系 (Coriell研究所) 起始 (一式两份)，分别使用PicoPLEX WGA v3,A公司试剂盒和B公司试剂盒，以及bulk gDNA对照制备全基因组扩增产物，进行SNV检测的比较。其中B公司试剂盒虽然制备了足够的扩增产物，但只有5 cells样本中一个包含足够的扩增子进行测序，而其他样本无可用数据进行测序。根据Genome In a Bottle (GIB) 和hg19 (human Genome assembly GRCh37, Ensembl) 数据库的交叉分析，预计GM12879细胞系总共存在78个SNVs。由于扩增子的设计，2×75 bp的读取长度很短，78个SNVs中的4个未能检测到。因此，检测的SNV总数减少到74个。使用VarDict软件，以≥10reads (10X coverage) 和等位基因频率≥20％为基准从BAM文件分析SNV。与其他两个公司试剂盒相比，PicoPLEX WGA v3具有更高的call rates和更低的等位基因丢失率。
（数据来源于Takara Bio USA, Inc.）
 
单细胞全基因组扩增分析
图2. 基于PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3的CNV检测
 
以来自不同细胞系(GM22601、GM05067和GM12878)的单细胞起始，使用PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3扩增基因组。之后取1ng的扩增产物，使用Illumina Nextera XT Kit制备文库，并在Illumina MiSeq（PE 75）进行测序。对Fastq文件去除接头序列信息后，与human genome assembly GRCh37进行比对。只分析常染色体。对于这两个panels，校准归一化至100万reads，使用bedtools 2.25.0计算每1 Mb的 bin的reads数。使用Integrative Genomics Viewer (IGV)绘制bin counts的log2 ratio (Sample/Reference)。PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3还显示了可以高品质的进行染色体异倍性分析。
 
单细胞全基因组扩增分析
图3. PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3的全基因组覆盖范围的重现性高
 
以GM12878的单细胞样本起始（一式两份），分别使用PicoPLEX WGA v3，A公司试剂盒和B公司试剂盒扩增基因组。之后取1ng的扩增产物，使用Illumina Nextera XT Kit制备文库，并在MiSeq（PE 75）进行测序。然后与human genome assembly GRCh37进行比对，归一化至1M reads (0.5M paired-end reads)后，使用bedtools 2.25.0计算每个1 Mb的bin的reads数。对这两个单细胞文库的每个窗口的total read进行绘制，计算Pearson和Spearman相关性并在每个图中标明。
Panel A. 包含异常值的样本。*由于不同技术存在不同的偏差，没有排除相关点，所以图表的比例不同。
Panel B. 排除异常值的样本。与A公司和B公司试剂盒相比，PicoPLEX WGA v3具有更高的重现性和覆盖度。
（数据来源于Takara Bio USA, Inc.）
 
 
Technote：单细胞全基因组扩增分析
 
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基因组DNA酶试剂盒Takara Clontech

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基因组DNA
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格（元） 说明书 数量
Clontech 636401 Human Genomic DNA 100 μg ￥4,083 基因组DNA 基因组DNA
Clontech 636402 Mouse Genomic DNA 100 μg ￥4,089 基因组DNA 基因组DNA
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Monarch 基因组 DNA 血液裂解缓冲液 货 号 #T3013L-NEB酶试剂 New England Biolabs

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产品资料 – 核酸纯化 – 基因组DNA提取

Monarch 基因组 DNA 血液裂解缓冲液                              收藏

货 号
规 格
价 格(元)
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#T3013L
20 ml
589.00
无
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特性

从多种样本（细胞、血液、组织和其他）中提取高质量gDNA
极低的 RNA 残留（通常＜ 1%）
提取的 gDNA 片段更长（最高峰值≥50kb）
操作便捷友好，提取快速，裂解充分
试剂盒可以纯化基因组DNA
试剂盒组分可以单独购买
Monarch基因组 DNA 提取试剂盒是NGS实验中NEBNext建库产品的完美补充。提取的长片段DNA，是长读长测序平台的上游纯化的首选。

概述

 Monarch基因组 DNA 提取试剂盒是NGS实验中NEBNext建库产品的完美补充。提取的长片段DNA，是长读长测序平台的上游纯化的首选。

Monarch 基因组 DNA（gDNA）提取纯化试剂盒集细胞裂解、RNA 去除和完整 DNA 纯化为一体，可用于多种生物样品如培养细胞、血液和哺乳动物组织。对难裂解的样品如细菌和酵母，试剂盒提供加强裂解步骤，以获得裂解充分的样品。说明书中还详述了临床样品如唾液和颊粘膜拭子的 gDNA提取过程，对于已经提取的 gDNA样品，说明书同样详述了快速纯化步骤。提取的 gDNA具有最高质量，通常A260/280＞1.8、A260/230＞2.0、高DIN 分值和极低残留 RNA。本试剂盒提取的 gDNA适用于终点 PCR、qPCR 和NGS 文库制备等多种下游应用。 峰值片段大小一般是50-70kb，特别适用于长读长测序平台。

组分

 Monarch基因组 DNA提取试剂盒组分
-Monarch 基因组 DNA 纯化柱
-Monarch 收集管II
-Monarch基因组 DNA 组织裂解缓冲液
-Monarch基因组 DNA 细胞裂解缓冲液
-Monarch基因组 DNA 血液裂解缓冲液
-Monarch基因组 DNA 结合缓冲液
-Monarch 基因组 DNA 洗涤缓冲液
-Monarch 基因组 DNA 洗脱缓冲液
-Monarch RNase A
-蛋白酶 K，分子生物学级
 
Monarch 基因组 DNA 血液裂解缓冲液 货 号 #T3013L
Monarch 基因组 DNA 血液裂解缓冲液 货 号 #T3013L
 
Monarch 基因组 DNA 血液裂解缓冲液 货 号 #T3013L
Monarch 基因组 DNA 提取试剂盒可以从多种样本中高效提取高质量、高分子量的基因组DNA。
每个样本各取100 ng基因组DNA，用0.75%琼脂糖胶电泳上样。血液、培养的细胞和组织用标准说明书，颊粘膜拭子、唾液、革兰氏阴性菌和阳性菌用补充说明书进行提取。起始材料：1X106Hela 细胞、100 μl人类血液、10 μl鸟类血液、10 mg冷冻组织粉末、1个颊粘膜拭子、500 μl唾液和～ 1X109 细菌细胞。使用Lambda DNA-Hind III digest (NEB #N3012)作为 marker 上样于最后一条泳道。提取出的 gDNA 样本用Genomic DNA ScreenTape® ，在 Agilent Technologies® 4200 TapeStation® 上进行分析。样本通常产量峰值在 50-70 Kb之间，DINs在9左右。在准备颊粘膜拭子和唾液的过程中，不可避免会出现细胞破损，这会导致形成弥散状的低分子量凋亡条带。
Monarch 基因组 DNA 血液裂解缓冲液 货 号 #T3013L

 Monarch基因组 DNA提取试剂盒提取出的高质量基因组DNA适用于长片段PCR 和 qPCR 等灵敏下游实验。

A:每个样本用 25ng 人DNA作为模板，用 LongAmp® Hot Start Taq 2X Master Mix（NEB #M0533）和特异引物分别扩增出6、8、10、12 、16 、20 kb的扩增子产物。PCR反应在Applied Biosystems® 2720 热循环仪中进行。Hela细胞 DNA 和人源血液基因组 DNA 用 Monarch试剂盒提取，与商业化的人源细胞系 NA19240 F11 参照 DNA 进行比较。分别取 10 ul上样于1.5%的琼脂糖胶，用 1 kb DNA Ladder（NEB #N3232）作为 Marker。胶图结果显示DNA高度完整，非常适合长片段PCR。
B：从人全血、Hela细胞和小鼠鼠尾用Monarch试剂盒提取基因组 DNA，10 倍系列稀释 5 次作为起始 DNA 模板浓度。在Bio-Rad® CFX Touch qPCR thermal cycler仪器中，用Luna® 通用 qpcr预混液(NEB#M3003) 和 特异引物对gHEME(人类全血)和gREL（Hela,小鼠鼠尾）进行PCR检测。实验结果显示 DNA 具有高纯度，不含抑制剂，非常适合qPCR。
 

 

Monarch 基因组 DNA 洗涤缓冲液 货 号 #T3015L-NEB酶试剂 New England Biolabs

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产品资料 – 核酸纯化 – 基因组DNA提取

Monarch 基因组 DNA 洗涤缓冲液                              收藏

货 号
规 格
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上海库存
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#T3015L
60 ml
499.00
无
无
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无
无

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特性

从多种样本（细胞、血液、组织和其他）中提取高质量gDNA
极低的 RNA 残留（通常＜ 1%）
提取的 gDNA 片段更长（最高峰值≥50kb）
操作便捷友好，提取快速，裂解充分
试剂盒可以纯化基因组DNA
试剂盒组分可以单独购买
Monarch基因组 DNA 提取试剂盒是NGS实验中NEBNext建库产品的完美补充。提取的长片段DNA，是长读长测序平台的上游纯化的首选。

概述

 Monarch基因组 DNA 提取试剂盒是NGS实验中NEBNext建库产品的完美补充。提取的长片段DNA，是长读长测序平台的上游纯化的首选。

Monarch 基因组 DNA（gDNA）提取纯化试剂盒集细胞裂解、RNA 去除和完整 DNA 纯化为一体，可用于多种生物样品如培养细胞、血液和哺乳动物组织。对难裂解的样品如细菌和酵母，试剂盒提供加强裂解步骤，以获得裂解充分的样品。说明书中还详述了临床样品如唾液和颊粘膜拭子的 gDNA提取过程，对于已经提取的 gDNA样品，说明书同样详述了快速纯化步骤。提取的 gDNA具有最高质量，通常A260/280＞1.8、A260/230＞2.0、高DIN 分值和极低残留 RNA。本试剂盒提取的 gDNA适用于终点 PCR、qPCR 和NGS 文库制备等多种下游应用。 峰值片段大小一般是50-70kb，特别适用于长读长测序平台。

组分

 Monarch基因组 DNA提取试剂盒组分
-Monarch 基因组 DNA 纯化柱
-Monarch 收集管II
-Monarch基因组 DNA 组织裂解缓冲液
-Monarch基因组 DNA 细胞裂解缓冲液
-Monarch基因组 DNA 血液裂解缓冲液
-Monarch基因组 DNA 结合缓冲液
-Monarch 基因组 DNA 洗涤缓冲液
-Monarch 基因组 DNA 洗脱缓冲液
-Monarch RNase A
-蛋白酶 K，分子生物学级
 
Monarch 基因组 DNA 洗涤缓冲液 货 号 #T3015L
Monarch 基因组 DNA 洗涤缓冲液 货 号 #T3015L
 
Monarch 基因组 DNA 洗涤缓冲液 货 号 #T3015L
Monarch 基因组 DNA 提取试剂盒可以从多种样本中高效提取高质量、高分子量的基因组DNA。
每个样本各取100 ng基因组DNA，用0.75%琼脂糖胶电泳上样。血液、培养的细胞和组织用标准说明书，颊粘膜拭子、唾液、革兰氏阴性菌和阳性菌用补充说明书进行提取。起始材料：1X106Hela 细胞、100 μl人类血液、10 μl鸟类血液、10 mg冷冻组织粉末、1个颊粘膜拭子、500 μl唾液和～ 1X109 细菌细胞。使用Lambda DNA-Hind III digest (NEB #N3012)作为 marker 上样于最后一条泳道。提取出的 gDNA 样本用Genomic DNA ScreenTape® ，在 Agilent Technologies® 4200 TapeStation® 上进行分析。样本通常产量峰值在 50-70 Kb之间，DINs在9左右。在准备颊粘膜拭子和唾液的过程中，不可避免会出现细胞破损，这会导致形成弥散状的低分子量凋亡条带。
Monarch 基因组 DNA 洗涤缓冲液 货 号 #T3015L

 Monarch基因组 DNA提取试剂盒提取出的高质量基因组DNA适用于长片段PCR 和 qPCR 等灵敏下游实验。

A:每个样本用 25ng 人DNA作为模板，用 LongAmp® Hot Start Taq 2X Master Mix（NEB #M0533）和特异引物分别扩增出6、8、10、12 、16 、20 kb的扩增子产物。PCR反应在Applied Biosystems® 2720 热循环仪中进行。Hela细胞 DNA 和人源血液基因组 DNA 用 Monarch试剂盒提取，与商业化的人源细胞系 NA19240 F11 参照 DNA 进行比较。分别取 10 ul上样于1.5%的琼脂糖胶，用 1 kb DNA Ladder（NEB #N3232）作为 Marker。胶图结果显示DNA高度完整，非常适合长片段PCR。
B：从人全血、Hela细胞和小鼠鼠尾用Monarch试剂盒提取基因组 DNA，10 倍系列稀释 5 次作为起始 DNA 模板浓度。在Bio-Rad® CFX Touch qPCR thermal cycler仪器中，用Luna® 通用 qpcr预混液(NEB#M3003) 和 特异引物对gHEME(人类全血)和gREL（Hela,小鼠鼠尾）进行PCR检测。实验结果显示 DNA 具有高纯度，不含抑制剂，非常适合qPCR。