Oligo(dT) Primer和Random Primers的区别

1、Oligo(dT ) Primer也可称为寡聚胸腺嘧啶引物，是只有胸腺嘧啶组成的寡居核苷酸链，长度范围在10～20个碱基之间，常用的Oligo(dT )Primer有15碱基、16碱基和18碱基。

Oligo(dT ) Primer利用了碱基互补配对的原则以及mRNA含有poly（A）尾巴的特点，巧妙设计而成。由于这个特点，使得Oligo(dT ) Primer只能和mRNA配对，并在适宜的条件下完成反转录。原核生物的RNA，真核生物的rRNA和tRNA无poly（A）尾巴，因此用Oligo(dT ) Primer作为反转录引物时，这些RNA均不能作为模板。这限制了反转录后获得的总cDNA的数量和种类。另外，若mRNA过长，可能会形成二级结构，这时Oligo(dT ) Primer扩增也会有一定的困难。同样提示我们，在反转录时根据需要选择引物。

2、Random Primers即随机引物，常用长度是6碱基或9碱基，它是一种混合体，在每一个位置上四种碱基都可以随机的出现，如AATCGC，TTAAGCG等，如此可以有46或49种组合。

随机引物可以根据碱基情况结合到几乎所有的RNA上，包括mRNA、tRNA和rRNA。因此Random Primers适用于mRNA、tRNA和rRNA等所有RNA的反转录反应，适用于长的或具有发卡结构的RNA，对物种没有限制，病毒、细菌、植物、动物等都可使用。

3、目前有的公司和实验室提倡Oligo(dT)和Random Primers混合使用，以此保障获得更为完整的cDNA。