GelRed核酸染料的常见问题

GelRed核酸染料是一种具有凝胶染色特性，并被设计为替换高毒性染色剂－溴化乙锭（EB）的红色荧光核酸染色剂。
GelRed核酸染料既可用于前染(precast gel staining)，也可用于后染(post gel staining)。通常后染比前染能够获得更灵敏的特性，并能排除染色剂在电泳过程中对核酸条带分离造成任何影响的可能性。然而，前染较后染更为简单、经济，因为前染不需要额外的着色过程，并且燃料用量更少。因此，假如灵敏度和条带清晰度不成问题，前染则是首选。我们强烈建议您尝试两种染色方法，以便根据您的需要选择最佳的染色方法。
GelRed＆GelGreen常见问题：
问:  污染或微笑的DNA条带或错误的DNA迁移条带?
答:  许多客户为方便使用GelRed预制凝胶。但GelRed和GelGreen是为安全而设计的分子量较大的高效1.亲和型染料，在预制凝胶电泳中它们可以影响DNA的迁移。如一些限制性酶切的DNA样本，可能会在2.GelRed预制凝胶中异常迁移。下列建议可能会提高预制凝胶中的条带分离效果。
3.减少DNA上样量。污染和微笑条带往往是过量的DNA样本造成的。推荐的泳道和已知浓度的样品的上样量为50-200ng/泳道。对于未知浓度的样品，尝试1/2或1/3的常用上样量
4.减少GelRed在凝胶中的总量，比如用0.5X的浓度来代替1X的浓度。
5.制百分比浓度小的琼脂糖凝胶。高分子量的DNA在低百分比的琼脂糖凝胶分离效果比较好。
6.更换电泳缓冲液。 TBE缓冲液比TAE缓冲液的效果更好。
7.为了避免染料可能对DNA迁移的干扰，我们建议使用电泳后染胶。如果跑胶程序需要的上样量超过推荐量，建议使用电泳后染色法。
问：荧光弱，时间久染料性能降低，或使用后染法染料仍然在琼脂糖凝胶中。
答：染料可能从溶液中沉淀。
加热GelRed至45 – 50℃，2min，搅拌溶解。
染料在室温下储存，以避免沉淀。
问:后染法需要去除染料的步骤吗？
答：不需要，不过高背景的结果可以考虑适当脱色步骤
问：GelRed和GelGreen可以用来染色单链DNA或RNA吗？
答：GelRed和GelGreen可用于单链DNA和RNA的染色，但GelRed染单链核酸效果比GelGreen敏感5倍左右。使用荧光酶标仪的滴定实验表明， GelRed绑定单链DNA和RNA荧光信号约是结合双链DNA的一半左右。
问：什么样的发射滤波片适合使用GelRed和GelGreen？
答：GelRed使用溴化乙锭滤片; GelGreen使用SYBR Green或黄色滤片。另外，长通道黄色滤片可用于GelRed或GelGreen。请查阅GelRed和GelGreen更多的特定波长的发射光谱。
问：可以提前制作GelRed / GelGreen凝胶，储存供以后使用吗？
答：可以，GelRed和GelGreen染料是稳定的。在保证琼脂糖凝胶的完整性不会被破坏的前提下，你可以将预制的GelRed / GelGreen凝胶储存供以后使用。 我们建议在4℃避光贮存凝胶。
问：GelRed / GelGreen在熔化的琼脂糖中稳定么？可以将GelRed / GelGreen储存在熔化的琼脂糖胶中，到用的时候在制备凝胶吗？
答：可以，GelRed比GelGreen更加稳定。但我们不建议将GelRed放在熔化的琼脂糖中存放几天。
问：GelRed /GelGreen的预制凝胶可以重复使用吗？
答：不可以，我们不建议GelRed / GelGreen凝胶电泳后重复使用，因为连续电泳会减少染色强度。
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